清屬寧海縣南鄉(xiāng)梅家莊。
民國17年（1928）屬方巖鄉(xiāng)。
民國24年屬楊家鄉(xiāng)。
民國29年（1940）三門建縣前后均屬楊家鄉(xiāng)。
1949年解放初沿用舊制。
1950年5月屬壩頭鄉(xiāng)。
1955年成立下吳初級(jí)社。
1957年初加入壩頭聯(lián)合高級(jí)社，同年分出，自建下吳高級(jí)社。
1958年冬，改稱下吳生產(chǎn)隊(duì)，屬壩頭管理區(qū)。
1961年屬壩頭鄉(xiāng)人民公社下吳大隊(duì)。
1984年全縣政社分設(shè)時(shí)，石門坑村歸屬高枧鄉(xiāng)。
成立村民委員會(huì)，屬壩頭鄉(xiāng)。
2001年行政區(qū)劃調(diào)整，撤銷壩頭鄉(xiāng)，改屬亭旁鎮(zhèn)。