以錦南街道橫溪源頭為名。
南宋咸淳間（1265～1274）屬臨安縣慶仙鄉，明代仍之，清乾隆二十四年（1759）深湖、甘山屬慶仙二圖。
民國初屬慶鳳鄉，民國17年（1928）屬慶鳳區，民國24年（1935）屬甘樟鄉，民國30年（1941）深塢里、甘山腳、荷花塘屬橫溪鄉，民國34年（1945）屬錦南鄉至解放。
1950年為甘樟鄉甘樟村，1956年為甘山高級社，1958年為臨安公社甘山、甘嶺、深湖生產隊，1961年為上甘公社甘山、甘嶺、深湖生產大隊，1984年為上甘鄉甘山、甘嶺、深湖村，2001年屬上甘街道。
2008年1月三村合并為錦南街道錦源村，轄6個自然村。