清時屬五甲。
1939年屬七區。
1950年屬五區壽屏鄉；1951年屬五區新寨鄉；1952年屬五區設水井鄉；1953年屬五區馬店鄉；1958年屬五區躍進人民公社馬店管理區；1961年屬小河區馬店公社；1962年屬新店區設水井公社；1970年屬新店公社稱水井大隊；1984年屬新店區稱水井鄉；1988年屬六合鄉稱水井行政村；2000年屬六合鄉稱水井村民委員會；2006年劃歸新店鄉仍稱水井村民委員會；2012年屬新店鎮仍稱水井村民委員會，自得名以來沿用至今。