西漢元鼎六年（前111），河口屬牂牁郡進�？h管轄，并在此置有進桑關。
后漢改進�？h為進乘縣，南宋時期屬寧州梁水郡，初唐時期屬品州八稱縣（駐今蒙自），南詔時期屬通海郡（駐今通海），宋代大理國時改通�？樾闵娇�，河口分屬舍資、屈中、阿馬和阿月等部，元設臨安、廣西、元江等處宣慰司，河口屬宣慰司的阿僰部舍資千戶（駐今蒙自老寨）。
明屬臨安府王弄山長官司（駐今文山回龍）。
清康熙四年（1665），改屬開化府安平廳（駐今文山，后遷駐馬關）。
光緒二十一年（1895），根據《中法條約》，辟河口為商埠，設河口副督辦，隸屬臨開廣道。
1914年，改副督辦為督辦，真屬省府管轄。
1927年劃河口為特別行政區，1949年12月25日，中國人民解放軍解放河口，1950年元月1日成立河口縣人民政府，隸屬蒙自專區。
1950年5月13日經云南省人民政府批準改縣為市，1955年又改市為縣，1959年與屏邊縣合并，仍稱河口縣，1962年河口、屏邊恢復原建制，1963年7月11日成立河口瑤族自治縣，隸屬紅河哈尼族彝族自治州。