“十二邦”時期，今日喀則市境內由數邦分裂割據。
今江孜、白朗一帶是娘若切噶爾的轄區；仁布一帶是努域靈古轄區；康馬一帶歸杰耶芒布王；定結、亞東、崗巴一帶隸屬斯布域仲杰那囊王；南木林縣鄔郁一帶由歐杰素擦王統治。
吉隆、薩嘎、仲巴等地歸象雄阿爾巴管轄；薩迦、拉孜、定日、昂仁等地由藏博瑪爾蒙統治。
7世紀中葉，松贊干布建立吐蕃政權后，在今日喀則市轄區內設“葉茹”與“如拉茹”兩茹。
9世紀中葉，吐蕃政權崩潰后又陷入分裂割據狀態。
10世紀初，貝科贊在仲巴拉孜建立王朝。
至其孫白德時，以今吉隆縣貢當為中心，形成“貢塘王系”。
貝科贊之孫吉德一族占據年楚河流域，形成“卓地王系”。
北宋熙寧六年（1073），薩迦派（花教）在薩迦興起。
宣和三年（1121），瓊波南交在南木林香地方修建香寺，香巴噶舉派在后藏興起。
13世紀中葉，蒙古汗（后為元朝）在西藏設立烏思藏納里速古魯孫等三路宣慰使司都元帥府，其中“藏”指吐蕃時期的葉茹、如拉茹兩翼，相當于今日喀則市的轄區。
南宋景定四年（1263），薩迦白蘭王恰那多吉，返回薩迦，建立薩迦政權，總管烏思藏軍民事務。
南宋咸淳四年（1268），薩迦本飲釋迦桑布對烏思藏進行戶口清查，實行“13萬戶”政區建置。
后藏地區設有7個萬戶府。
14世紀中葉，薩迦政權走向崩潰。
元至正十四年（1354，藏歷第六饒迥木馬年），帕木竹巴派取代薩迦巴建立了帕木竹巴地方政權，取得了對烏思藏大部分地區的統治權。
但薩迦本土仍由薩迦萬戶管轄。
明廷在仁蚌（仁布）設“領司奔寨行都司”。
此外，帕木竹巴政權在烏思藏地方實施“宗溪”制度，相繼建立了13個大宗。
15世紀30年代始，仁蚌巴家族以仁蚌宗為政權中心，統治了后藏地區的大部分宗溪。
16世紀中葉，辛廈巴·才旦多吉聯合后藏西部勢力，推翻了仁蚌巴家族的統治，控制了仁蚌巴家族統治的區域，自稱“藏堆杰波”（后藏之王）。
史稱“第巴藏巴汗政權”。
至其孫噶瑪丹迥旺波執政時，以今桑珠孜區為中心，烏思藏大部分地方歸其治下。
明崇禎十五年（1642），噶丹頗章政權推翻了“第巴藏巴汗政權”。
后藏地區大部分宗溪屬噶丹頗章管轄。
清康熙五十二年（1713），清廷將后藏的拉孜、昂仁、彭措林、崗巴、達木薩迦、謝通門、梅康薩、達那仁欽則、蘭倫繞等宗溪賜予五世班禪羅桑益西管轄，并準予世襲。
清乾隆十六年（1751），正式建立西藏地方政府。
清乾隆五十八年（1793），清廷在《藏內善后章程二十九條》中明令西藏的濟嚨（今吉隆）、聶拉木、絨夏、喀達、薩噶、昆布等地區，在與廓爾喀疆土邊界處樹立界碑。
1921年，西藏地方政府設基宗，管理后藏地區。
1923年冬，十三世達賴令西藏地方政府掌管了班禪所轄寺院及其政區。
1951年5月，中央人民政府與西藏地方政府簽訂《和平解放西藏辦法的協議》（十七條協議），恢復了十世班禪額爾德尼固有的地位和職權。
1953年，政務院批準設立“班禪堪布會議廳”，管轄十世班禪額爾德尼屬區的一切政教事務。
1954年，西藏地方政府設藏區總管，管轄日喀則宗等21個宗溪。
1956年8月，自治區籌委會設立江孜基巧辦事處。
1956年9月，西藏自治區籌備委員會設立日喀則基巧辦事處。
1959年10月，成立日喀則專區。
1965年9月，西藏自治區成立，同時成立日喀則專員公署。
1970年11月，日喀則專區更名為日喀則地區。
2014年6月，撤銷日喀則地區設立地級日喀則市，原縣級日喀則市改設桑珠孜區。