巴依托海鄉位于縣城東南，鄉機關距吉里于孜鎮56公里，省道315線縱貫其東。東隔喀什河與薩木于孜鄉相望，南瀕伊犁河，西接英塔木鄉，北連維吾爾玉其溫鄉。東西最寬11公里，南北最長13.5公里，總面積141.34平方公里。轄12個村民委員會，18個自然村，46個村民小組，2791戶，13815人，勞力4299人，總人口中男7581人，女6234人，非農業人口547人，未落戶的常住人口226人。有維吾爾、漢、回等12個民族，其中維吾爾族7801人，占56.5%，漢族3278人，占24%、回族1261人，占9%、東鄉族891人、占6.5%，哈薩克族495人、占3.6%；余為烏孜別克、撒拉、俄羅斯、土、壯、柯爾克孜等族。
新中國成立初定名八區八鄉，1952年6月改制為四區八鄉，1954年改稱五區七鄉，1958年改為天山公社四大隊，1972年析置為巴依托海公社，轄5個大隊。1984年撤社建鄉，沿用公社名稱。黨政機關駐塔依爾于孜村南。
該鄉地處喀什河西岸沖積—洪積平原，海拔650—760米，全境分平原區和伊犁、喀什兩河漫灘兩大部分，地勢平坦，水源充足，屬團結渠灌區、水利設施完善。河灘低價地生長著河柳、胡楊、小沙棗等次生林及草本植物，是良好的天然牧場，為發展農牧業提供了優越條件。轄區平均氣溫8.5℃，年降水量340毫米，無霜期164天。經濟以農為主，農牧并舉，工副、運輸、修理、餐飲、商業都有較大發展。
“巴依托海”系突厥語，意為“宣繞的灌木叢”，史書稱“巴依圖海”、“巴爾托輝”，其范圍包括今巴依托海和英塔木兩鄉。