民國時期，屬老林第九保、金埡第二保。
1951年，建政為玲瓏鄉第一村。
1955年，建社為玲瓏鄉第一村。
1958年，為金埡公社第四管理區。
1962年，為玲瓏公社一大隊。
1967年，改為光明公社一大隊。
1972年，仍為玲瓏公社一大隊。
1981年，地名普查時命名為玲瓏公社宗祠大隊。
1984年，為玲瓏鄉宗祠村。
1992年，撤區并鄉建鎮后為黃渡鎮宗祠村。
1997年，玲瓏鄉恢復建制，為玲瓏鄉宗祠村。
2019年，根據川府民政[2019]9號文件批準，劃歸黃渡鎮管轄。
2020年，村級建制調整，撤銷牛心村和宗祠村，合并設立宗祠村（營府函〔2020〕72號）。