解放初屬漁箭鄉加強村。
1958年屬漁箭公社四管區。
1961年為漁箭公社四大隊。
1981年地名普查時改為漁箭公社石廟子大隊。
1984年改為石廟子村。
1992年撤區并鄉擴建鎮時劃歸石碾鎮管轄。
1997年成立漁箭管理區委員會，隸屬漁箭管理區委員會。
1999年元月后隸屬漁箭鎮。
2019年12月鄉鎮行政區劃調整改革時漁箭鎮并入石碾鎮，隸屬石碾鎮，2020年5月村級建制調整改革時黑水凼村和石廟子村合并為石廟子村，隸屬石碾鎮。