以境內貓兒寨而命名。
1952年置過龍廟村，中江縣轄，1953劃歸樂至縣，1958年改為6大隊，1981年地名普查時更名為貓兒溝大隊，1984年撤大隊復村。
1986年根據樂至縣相關文件精神成立貓兒溝村民委員會和肖家灣村村民委員會，常新村村民委員會，分別坐落于貓兒溝村3組、貓兒溝村9組、貓兒溝村14組。
2021年根據樂至縣建制調整文件精神，原貓兒溝村和肖家灣村、常新村整體合并為貓兒溝村，撤銷原貓兒溝村、肖家灣村、常新村村民委員會，組建成立貓兒溝村村民委員會。