清康熙年間屬忠義里轄，雍正七年屬于忠義鄉轄，宣統三年屬于忠義鎮轄，1945年又屬于忠義鄉轄。
1950年建政置總旗鄉，此村屬于總旗鄉轄。
1958年總旗鄉并置為鐵清公社，村名為瓦窯大隊，屬于鐵清公社轄，1962年復名為總旗公社，屬于四面山區轄，村名為瓦窯大隊，屬于總旗公社轄。
1978年撤區并入四面山公社，村名為瓦窯大隊，屬于四面山公社轄。
1980年恢復區社建制，仍為總旗公社，村名為瓦窯大隊，屬于總旗公社轄。
1984年撤社設鄉，村名為瓦窯村，屬于總旗鄉轄，1992年撤鄉并鎮，村名為瓦窯村，屬于四面山鎮轄。
2019年村級建制調整改革撤銷九臺村，以原瓦窯村、原九臺村所轄范圍合并設立瓦窯村，屬四面山鎮轄。