秦屬巴郡。
漢建元六年（前135），開“西南夷”，縣地屬犍為郡。
三國、兩晉時，隸于江陽郡。
隋大業三年（607），屬瀘州郡合江縣轄地。
唐元和元年(806)置羈縻藺州。
宋乾德二年(964)廢州，地入合江縣。
元屬永寧路。
明為永寧宣撫司轄地。
清雍正九年(1731)設古藺巡檢司，隸敘永廳。
清光緒三十三年(1907)永寧縣移治于此，翌年更名古藺縣，以古為藺州地得名，屬永寧州。
1914年隸永寧道。
1935年屬第七行政督察區。
1949年屬川南行政區瀘縣專員公署。
1952年屬四川省隆昌專員公署。
1960年并入宜賓專區。
1985年，省轄瀘州市成立，屬瀘州市管轄。