清康熙三十年(1691)，富順縣區劃為四鄉八路，琵琶場保為在城鄉下東路。
民國元年（1912）設琵琶團和杜快團。
民國二十三年（1934），琵琶團和杜快團合并為琵琶鄉，自此正式成為一級基層鄉級機關。
民國二十四年（1935年），琵琶鄉改鎮。
民國二十八年（1939）改稱琵琶鎮和杜快鄉。
民國三十八年9月（1949）琵琶、杜快合稱琵杜鄉。
琵琶鄉仍為一鄉建制，1949年12月，縣人民政府成立后，鄉（鎮）保甲制改為鄉（鎮）村組制，撤銷琵杜鄉分設為7個小鄉，隸屬14區，1955年11月，改屬童寺區。
1956年，鄉改公社。
1958年改稱公社，隸屬城郊區，1983年12月，公社改鄉。
1995年9月，琵琶鄉與杜快鄉并為琵琶鎮，同時撤銷城郊區，直屬縣人民政府管轄。
2019年8月，將原萬壽鎮青山村、建國村、洞上村和安溪鎮順江村所屬行政區域劃歸琵琶鎮管轄。