明清時期屬西區九局。
民國時期屬4區。
1927年全縣分4區，神底屬于四區的一個主村。
1949年10月1日，中華人民共和國成立后，仍實行民國區村制。
全縣設6個區，71個行政村，神底成為行政村。
1958年11月，鄉寧縣與吉縣合并，稱鄉吉縣。
1959年1月，增設寬井人民公社，轄神底鄉，3月，神底鄉改成神底管理區。
1961年4月，鄉寧、吉縣分置，全縣共有16個人民公社，成為譚坪人民公社神底生產大隊。
1984年7月，實行政社分開，建立鄉（鎮），成為譚坪鄉神底村民委員會。
2001年3月，撤并鄉鎮，譚坪鄉、棗嶺鄉合并稱棗嶺鄉，成為棗嶺鄉神底村民委員會并沿用至今。