1961年設立昆山生產大隊；1984年撤銷昆山生產大隊，設立昆山村村民委員會。
1953年至1955年為古郊區（六區）蒼郊鄉昆山自然村，1956年至1957年為古郊基點嶺東鄉昆山自然村，1958年至1960年為古郊紅星公社昆山管理區，1961年至1983年為古郊公社昆山大隊，1984年至2000年為古郊鄉昆山村委會，2001年將馬武寨鄉并入古郊鄉，以原馬武寨鄉、古郊鄉的行政區域為現古郊鄉的行政區域，至今為古郊鄉昆山村村民委員會。