解放前,白河縣劃歸湖北省鄖縣,隸屬中廠三呂。
1949年解放后,劃入白河縣轄區管理。
1951年,三院、花灣、新莊和荊竹4個互助組均屬二區大雙鄉;新紅互助組屬二區秧田鄉。
1954年,三院、花灣、新莊和荊竹4個互助組分別轉為高級社,均屬二區大雙鄉;新紅互助組轉為高級社,屬二區秧田鄉。
1956年,三院、花灣、新莊、荊竹和新紅5個高級社均屬冷水區大雙鄉。
1958年,三院、花灣、新莊、荊竹和新紅5個高級社分別轉為大隊,均屬冷水公社大雙管區。
1962年,三院、花灣、新莊、荊竹和新紅5個大隊均屬冷水區大雙公社。
1984年5月,三院、花灣、新莊、荊竹和新紅5個大隊均屬冷水區大雙鄉。
1996年11月,三院、花灣、新莊、荊竹和新紅5個大隊分別變更為三院、花灣、新莊、荊竹和新紅5個村村民委員會,屬大雙鄉。
2000年8月,撤銷新紅村村民委員會,將其轄區并入三院村村民委員會;撤銷新莊村民委員會,將其其轄區并入荊竹村村民委員會。
2004年2月,撤銷荊竹村村民委員會,將其轄區并入花灣村村民委員會,同時,將原花灣村3、5、6組并入三院村村民委員會;將三院村老新紅片劃入興隆村村民委員會。
2011年5月,三院村村民委員會屬冷水鎮。
2014年,將花灣村一組并入三院村村民委員會。
2017年9月,三院村村民委員會變更為三院社區村民委員會,屬冷水鎮至今。