原為昆山縣轄地，南宋嘉定十年（1218）十二月初九以年號為名，析昆山縣東境五鄉置嘉定縣，今馬陸地區屬嘉定縣春申鄉。
翌年，春申鄉易名守信鄉。
清康熙十年（1617）知縣趙昕賑災，四鄉分設粥廠。
馬陸地區設馬陸廠，宣統元年（1909）廠改稱鄉，馬陸廠改稱為馬陸鄉。
1914年稱第八區。
1928年撤銷并入嘉定市。
1934年復置馬陸鄉。
1949年置馬陸區。
1957年1月撤區并鄉置馬陸鄉。
1958年9月成立馬陸人民公社。
1983年4月恢復馬陸鄉建制。
1993年3月撤鄉建鎮。
2001年7月撤銷馬陸鎮、戩浜鎮，合并成立新的馬陸鎮，沿用至今。