南站鎮是濟寧市委市政府創新體制機制設立的十四處新型鄉鎮之一，2008年7月28日，汶上縣委、縣政府根據市委、市政府《關于進一步加強省級經濟開發區（工業園區）建設的意見》（濟發〔2008〕16號）、《關于推進新型鄉鎮建設試點工作的通知》（濟發〔2008〕20號）文件精神，將原汶上鎮的23個行政村并入南站鎮，與經濟開發區合為一體，組成新型鄉鎮。
新型鄉鎮轄54個行政村，區內總人口12萬人，其中常駐人口8.6萬人，版圖面積103平方公里，擴大了開發區規模和發展空間。近年來，在縣委、縣政府的堅強領導下，區鎮始終堅持以科學發展觀統攬經濟社會發展全局，立足“佛都新城、文化名鎮、發展特區、生態宜居”的新型鄉鎮發展定位，牢牢把握“高點定位跨越發展”的總基調，按照“產業興縣”和“開創工業振興新紀元”的總體要求，拼搏奮進，攻堅克難，區鎮經濟社會呈現出又好又快發展的良好態勢。