1965年，城關區劃出25個大隊、防山區劃出15個大隊，組建新書院區。
1966年改為東風區，1968年12月改為東風人民公社。
為保護文物古跡，1979年，區機關從洙泗書院遷至孔林東、104國道東側，即今址。
1980年，因與嘉祥縣東風人民公社重名，故復原名為書院人民公社。
1984年，社改為區。
是年，將坊上、林前、小北關、周公廟、盛果寺、古城、五泉莊、大莊劃歸曲阜鎮。
1986年區改鄉為書院鄉，先后將劉官莊、胡家行、裴家莊、龐家寨、顏子店、三官廟村注銷。
1997年撤書院鄉設立書院鎮。
2000年12月，撤銷書院鎮設立書院街道。
2020年6月、2021年3月行政村建制優化后轄24個村委會。