殷商時屬鄧國都。
春秋時屬魯國的曲池。
隋朝時為汶陽縣城，后為歷代基層政權的所在地。
明中葉至清，境域為成功社和義田社。
1930年去社改為區鄉制，此地與吳村為二區，境內有董家莊、衡廟、崄河、石門、董大城、北極、夏莊、石泉莊8個鄉。
1938年，實行區鄉保甲制，仍屬二區，境內有董家莊、衡廟、崄河、石門4個鄉、48個保、520個甲。
1946年屬吳村區。
1947年為建國鄉、石門鄉。
1948年屬吳村區。
1949年8月，將吳村區東南部劃出，設立董莊區，下設衡廟、董家莊、四洼、管村、黃家莊、夏莊、大廟、西莊、梨園、歇馬亭10個鄉。
1950年8月，董莊區改為第十區，10個小鄉改建為10個高級農業社，設董家莊、林程店、歇馬亭3個鄉。
1955年5月又改為董莊區。
1956年3月撤銷董莊區，劃歸王莊區，林程店鄉、歇馬亭鄉劃歸吳村區。
1958年9月，在原董莊區的轄域成立董家莊（衛星）人民公社。
1965年8月至1966年5月，人民公社體制調整，原董家莊人民公社改稱董莊區。
轄董莊、歇馬亭、林程店、梨園、屈家村、河東、大廟7個人民公社。
1969年董莊區改為董家莊人民公社。
1984年5月，董莊人民公社撤銷改設董莊區。
轄董莊、管村、大廟、歇馬亭4個鄉。
1986年6月，撤縣建市，董莊區撤銷，區轄的4個鄉合并，設立董莊鄉。
2011年9月，經山東省人民政府（魯政函〔2011〕48號）批準，將董莊鄉更名為石門山鎮至今。
2020年行政村建制優化后轄26個村委會。