嘉祥縣位于山東省濟寧市西部，屬黃河沖積平原。東西寬16公里，南北長47.5公里，總面積975平方公里（含濟寧經開區代管的疃里鎮、馬集鎮）。東臨濟寧市任城區，南接金鄉縣，西靠菏澤市的巨野縣和鄆城縣，北依梁山縣，東北隔梁濟運河與汶上縣相望。縣城座落于縣境中部，地理座標為東經116°20′、北緯35°24′。縣城東至濟寧22公里，南至金鄉縣城45公里，西至巨野縣城23公里，北至梁山縣城50公里。現轄十五處鎮街(梁寶寺鎮、馬村鎮、大張樓鎮、紙坊鎮、金屯鎮、孟姑集鎮、仲山鎮、老僧堂鎮、滿硐鎮、黃垓鎮、疃里鎮、馬集鎮、嘉祥街道辦事處、臥龍山街道辦事處、萬張街道辦事處)和一處省級經濟開發區，559個行政村居，人口82萬人（含濟寧經開區代管的疃里鎮、馬集鎮）。縣政府駐嘉祥街道辦事處。
嘉祥縣大致呈西北東南方向的長方形。地勢自西北向東南傾斜，平均傾斜坡度為萬分之一。海拔高度一般在35～40米。低點在縣城東南金屯鎮東部，海拔35米；高點在縣城西北黃垓鎮中部，海拔40米。東南比西北相差5米，東比西相差3～4米。全縣有大小山頭126座，多是東北、西南走向，呈島狀突出平地，主峰海拔高度一般在50～200米，成為魯、豫、皖、蘇交界平原地帶的獨特自然景觀。紙坊鎮與（馬集鎮）交界處的孟良山(舊名塔山)，海拔243.1米，為全縣最高點。
嘉祥縣境位于黃泛沖平原的邊緣，平原主要分布于黃垓鎮、老僧堂鎮、孟姑集鎮、梁寶寺鎮、大張樓鎮、馬村鎮、萬張街道、嘉祥街道、臥龍山街道等；洼地主要分布于縣城、大張樓鎮、梁寶寺鎮和縣城東南部、金屯鎮東部、仲山鎮、滿硐鎮、紙坊鎮等。山地主要分布于紙坊鎮和滿硐鎮、仲山鎮西部、嘉祥街道的南部、臥龍山街道的中部和南部。
嘉祥縣屬暖溫帶季風區大陸性氣候，春旱多風，夏熱多雨，秋高氣爽，冬季干冷，四季分明。年平均氣溫12.8℃-13.9℃。在東亞季風影響和控制下，干濕季節分明，年降水量在季節分配上很不均勻。春季溫度回暖快，氣候多變，降雨稀少，多西南風。3～5月平均降水量99毫米，占年降水量的15%，而蒸發量大，常形成春旱，夏季炎熱多雨，高溫高濕，降水集中，常有暴雨。6―8月份平均降水量398.5毫米，占年降水量的60%。由于降水集中，強度大，多形成洪澇災害和旱澇相間發生。秋季氣溫急降，雨量減少，天多晴朗，9―11月平均降水量133.7毫米，占年降水量的20%，常發生秋旱。冬季常為高壓控制，氣候干冷，雨雪稀少，12月-2月平均降水量30毫米，占年降水量的5%。