1917年3月，北洋政府批準馬麟請求，設立玉樹理事（臨時縣級政權）。
1929年，青海建為行省，改玉樹理事為玉樹縣，管理玉樹全地區。
1933年，從玉樹縣劃出囊謙縣。
1937年，從玉樹縣劃出稱多縣，1939年，玉樹地區設立行政督察專員公署。
1949年9月，玉樹和平解放，馬氏家族覆滅。
1957年2月經玉樹地方委員會批準恢復玉樹縣，4月正式建立玉樹縣。
2013年07月04，根據（民函〔2013〕219號）文件，民政部《關于同意青海省撤銷玉樹縣設立縣級玉樹市的批復》撤銷玉樹縣，設立玉樹市，玉樹市轄3個鎮，5個鄉。
2014年4月，撤銷結古鎮，設立結古街道辦事處、新寨街道辦事處、西杭街道辦事處、扎西科街道辦事處，沿用至今。