1951年，屬第三行政區，為巴溝鄉和卡力崗鄉。
1953年，由同德藏族自治區改為同德縣以后，巴溝為當時同德下設6區中的一區。
1956年10月至1957年底，重編為第五區（巴溝）。
1958年3月，撤區并鄉時巴溝、卡力崗合并為巴溝鄉，同年10月，改巴溝鄉公社。
1963年，分為松多、巴溝、卡力崗3個農業公社。
1965年，將原有的卡力崗公社、松多公社、巴溝公社合并為巴溝鄉。
1970年，改為巴溝人民公社。
1984年4月，復為巴溝鄉。