清雍正十二年(1734年),設薩拉齊筆帖式。
道咸年間,設薩拉齊城關,隸薩拉齊通判廳。
同治四年(1865年),升為同知廳。
民國元年(1912年),改為薩拉齊縣。
1950年11月至1952年11月,薩拉齊為薩縣專員公署駐地。
1954年春,結束蒙漢分治,將土默特旗6區并入薩拉齊縣。
1958年5月,又將薩拉齊縣并入土默特旗,薩拉齊鎮為旗政府駐地。
10月,成立薩拉齊太陽人民公社。
1959年4月,改稱薩拉齊鎮人民公社。
1969年,土默特旗分設土默特右旗、土默特左旗,薩拉齊鎮為土默特右旗駐地至今。
1973年,薩拉齊鎮人民公社分為薩拉齊鎮人民公社和薩拉齊人民公社。
1986年,薩拉齊鄉并入薩拉齊鎮。
2006年2月,吳壩鄉并入薩拉齊鎮。