洪門鎮的前身為硝石古鎮，是西漢高祖五年（前202）南城始設縣所在地，歷史上曾是“八方重鎮，入閩咽喉”之地及南城縣政治文化活動中心，縣治在此482年。
1949年前夕屬六區，1949年10月后仍屬六區，1958年稱洪門公社，1968年并入龍湖公社稱紅湖公社，1972年劃出仍稱洪門公社。
1984年5月12日改公社建制為鄉建制，劃出包坊、李敖、上烏石三個大隊與上唐公社劃出的棠下、姑余、坊頭三個大隊成立包坊鄉，仍稱洪門鄉。
1985年3月15日，經江西省人民政府批準，撤鄉設鎮，稱洪門鎮。
2001年，撤銷包坊鄉，將包坊、李敖、上烏石三個村劃入洪門鎮。
同年11月，又將包坊、李敖、上烏石三個村劃歸上唐鎮，沿用至今。