春秋、戰國時期，先后是百越——越——楚屬地。
秦屬九江郡。
漢屬豫章郡、廬陵郡。
三國吳嘉禾五年（236），析廬陵郡置南部都尉，初定建制、轄域。
晉置南康郡。
南朝宋永初元年（420）改南康郡為南康國，南朝齊永明元年（483）復為南康郡。
隋開皇九年（589）改置虔州，隋大業元年（605），又改虔州為南康郡。
唐置虔州。
五代梁屬百勝軍，五代南唐改稱昭信軍。
宋初復稱虔州；宋淳化元年（990）析虔州之南康、大余、上猶三縣別置南安軍；宋紹興二十三年（1153），改虔州為贛州，贛州之名始此。
元置贛州路、南安路。
明置贛州府、南安府。
清初沿明制，清乾隆十九年（1754）析贛州府之寧都、瑞金、石城三縣，別置寧都直隸州。
1914年廢府、州，設贛南道。
1926年廢道，各縣直屬省。
1932年設第十一（駐寧都）、十二（駐贛縣）、十三（駐龍南）行政區，是年原屬豫章道的廣昌縣劃屬第十一行政區。
1935年改設第四（駐贛縣）、第八（駐寧都）行政區。
贛南解放后，于1949年9月，成立贛州專區、瑞金專區，與吉安專區同屬贛西南行政區。
1950年瑞金專區改稱寧都專區。
1951年撤銷贛西南行政區。
1952年撤銷寧都專區，除廣昌縣劃歸撫州專區外，原寧都專區轄縣皆屬贛州專區。
1954年撤銷贛州專區，改設贛南行政區，復將廣昌縣劃入。
1964年撤銷贛南行政區，改設贛州專區。
1970年以后稱贛州地區。
1983年廣昌縣劃歸撫州地區。
1994年南康、瑞金撤縣設市。
1998年撤地改市，原縣級贛州市改為章貢區。
1999年地級贛州市正式掛牌成立。
2013年11月8日，撤銷原縣級南康市，設南康區，同意將南康區潭口、潭東鎮劃贛州市章貢區管轄。
2016年10月，撤銷贛縣設立贛縣區。