1949年4月，為倪巷大隊，徐甲大隊，王巷大隊三個大隊。
1994年2月前，倪巷大隊、徐甲大隊、王巷大隊三個獨立的大隊隸屬于西陽鄉。
1994年2月，西陽撤鄉建鎮，倪巷大隊、徐甲大隊、王巷大隊三個大隊隸屬于西陽鎮。
2000年倪巷大隊、徐甲大隊、王巷大隊三個大隊合并更名為倪巷村。
2000年1月3日，茅麓鎮、西旸鎮合并為茅麓鎮，倪巷村隸屬于茅麓鎮。
2007年3月26日，茅麓鎮成建制并入原薛埠鎮，倪巷村隸屬于薛埠鎮。