晚清時期(光緒年間)屬石羊鄉；民國時期（1923年）隸屬第一區（縣城）；1937年并區后，屬第一區（縣城）白鶴鄉楊方會;1950年始建鐘劉村村公所隸屬白鶴鄉；1953年成立初級合作社；1957年轉入高級社；1958年成立上游（胡金店）人民公社，隸屬白鶴管理區白鶴公社鐘劉大隊；1970年鐘劉大隊、躍進大隊的王楊、吳陳合并改名為長征大隊；1981年1月以地命名，因位于三條港的匯合處而改名三港大隊；1984年元月設立三港村民委員會，屬胡金店區；1987年9月撤區并鄉，隸屬清明河鄉所轄。
2016年3月，三港村改三港社區，屬清明河鄉所轄。