明朝屬甘泉里。
清朝屬郝枧鋪。
民國初期沿襲清制，1921年隸屬西鄉，1936年隸屬第三區，1947年屬遠北鄉。
1950年3月為曬旗、九女、蓮花自然村，屬遠北區。
1955年1月三個自然村屬荷花區。
1956年夏成立曬旗、蓮花、九女高級農業合作社，隸屬青峰鄉。
1959年4月改稱曬旗、蓮花、九女生產隊，屬青峰管理區。
1961年5月改稱曬旗、蓮花、九女生產大隊，屬青峰公社。
1975年2月三個大隊改屬望家公社。
1984年2月改稱曬旗村、蓮花村、九女村，同時分別成立曬旗村、蓮花村、九女村村民委員會，屬青峰鄉。
1987年10月撤區并鄉，屬茍家埡鎮。
2001年3月，茍家埡鎮撤銷，成立荷花鎮，屬荷花鎮。
2002年10月，蓮花村、九女村與曬旗村合并為曬旗村，屬荷花鎮。
2014年10月，荷花鎮更名為嫘祖鎮，屬嫘祖鎮至今。