明、清時期隸屬于靈西鄉。
民國時期隸屬于第一區。
1930年4月至12月紅色政權期間隸屬于復興區。
抗戰時期隸屬于梅川區。
1943年復屬于靈西鄉。
1952年隸屬于第一區。
1958年9月成立馬垅大隊，隸屬于紅星公社。
同年12月隸屬于梅川公社。
1961年隸屬于梅川區。
1975年隸屬于南泉公社。
1984年全縣開展調整區、鄉、鎮設置工作，調整為馬垅村，隸屬于梅川區。
1987年隸屬于南泉鄉。
2000年橫崗鄉、南泉鄉、兩路鄉、梅川鎮合并為梅川鎮，隸屬于梅川鎮，沿用至今。