清光緒七年至宣統三年（1881-1911年），本縣共劃分12甲69聯保，五谷廟由大木團管轄；民國15年，本縣劃分為14個區，五谷廟歸大木區管轄；民國20年，賀龍率紅軍三軍到房縣，開辟了以房縣為中心的鄂西北革命根據地，建立縣、區、鄉蘇維埃政權，五谷廟隸屬大木區；民國23年，本縣又并為5個區，五谷廟歸五區大木廠鄉管轄；民國24年，本縣又恢復為8個區，五谷廟歸八區大木長鄉管轄；民國25年，廢聯保為鄉，五谷廟歸五區管轄；民國33年，將大木廠鎮更名為大公鎮；1949年8月，先后建立大木等區；1950年4月，本縣劃為大木等11個區，同年8月改大木為四區；1952年8月，全縣劃為1個鎮，14個區，276個鄉，五谷廟歸四區管轄；1955年是大木區五谷鄉轄區；1958年11月是大木公社五谷管理區的雙豐大隊、楊柳大隊、五谷大隊、黃糧大隊、新塘大隊；1961年為大木區五谷公社雙豐大隊、楊柳大隊、五谷大隊、黃糧大隊、新塘大隊；1975年3月為大木區大木公社雙豐大隊、楊柳大隊、五谷大隊、黃糧大隊、新塘大隊；1984年6月為大木區五谷廟鄉馬家臺村、柳樹埡村、五谷廟村、黃糧村、黃家營村；1987年11月為大木鎮五谷廟辦事處；1989年4為大木鎮五谷廟管理區；1999年11月12日，黃糧與黃家營合并為黃家營村，馬家臺與柳樹埡合并為馬家臺村，為大木鎮五谷廟管理區黃家營村、馬家臺村、五谷廟村；2001年4月，合鄉并鎮；2002年小村并大村，原馬家臺村、黃家營村、五谷廟村合并為大木廠鎮五谷廟村，下轄四個村民小組。