清末屬山陽一里;民國初年,漢陽縣建立十八個區,屬第十五區;1945年全縣分四鎮十九鄉,屬黃陵鄉;1949年全縣劃分為五區一鎮,屬一區;1952年組成同建一、三社,翌年轉為兩個高級社;1958年人民公社化時,改名小軍大隊,屬東風人民公社;1961年轉為國營東城垸農場,翌年劃為軍山公社,分為小軍、中嶺、磨子石、徐家堡4個大隊;1965年小軍、中嶺合并為小軍大隊;1984年改小軍村,設小軍村村民委員會,屬軍山鎮;2004年屬軍山街道;2014年因經濟開發,全村計劃拆遷,村委會和村民搬遷至小軍山社區。