寶泉鎮一帶開發歷史較早,清乾隆年間(1736-1795),隸屬依克明安旗管轄。
寶泉鎮駐地是清光緒年間(1875-1908)墨爾根城(今嫩江)至通肯城驛路的第四站(今永豐村)。
清光緒二十年(1894)劃歸布特哈副都統管轄。
中華民國成立后,初隸訥河縣管轄,1915年劃歸克山縣,隸屬第二區。
1929年12月劃歸克東設治局管轄。
東北淪陷后,初隸克東縣北保,1939年改設寶泉村。
1945年“九三”抗日戰爭勝利后,設置寶泉區,1949年改為第八區,1955年復稱寶泉區。
1956年4月,撤區劃鄉,分設寶泉、愛路、愛華、前進4個鄉。
1958年9月,將4個鄉合并成立寶泉人民公社。
1962年3月,由寶泉公社劃出部分區域,分設愛路、愛華公社。
1964年將愛華公社并入愛路公社。
1968年11月,將愛路公社并入寶泉公社。
1983年5月,撤銷寶泉公社,設置寶泉鎮,名稱沿用至今。