清代，屬呼蘭城守尉管轄地區。
清咸豐年間（1851-1861）實行屯墾戎邊，在泥河北部設立了20個營屯，分為正紅、正黃、鑲黃、正白4個旗，每旗分為5個屯。
清末，屬綏化府永安區。
1912年，隸屬永安鎮。
東北淪陷后期，設紅旗村。
1945年“九三”抗日戰爭勝利后，隸屬永安區管轄，1951年改隸第四區，1956年4月，并村劃鄉，設置紅旗鄉。
1958年8月，將永安、連崗、紅旗3個鄉合并成立永安人民公社。
1961年從永安公社劃出成立紅旗公社。
1984年3月，改設紅旗鄉。
1988年7月，改為紅旗滿族鄉，名稱沿用至今。