光緒二十七年(1901),石昭海來此地開荒種地,故名“石家屯”。
清光緒三十二年(1906),規劃拜泉縣管轄。
中華民國時期,稱“亨字頭排十二井子”。
東北淪陷后,1938年5月,為拜泉縣積善村。
1945年“九三”抗日戰爭勝利后,設置積善區,后改為第十六區。
1956年3月,撤區劃鄉,設置新農鄉。
1958年9月,改稱愛農人民公社。
1962年將西南部地區劃出,成立自強公社。
1984年初,政社分開,改為愛農鄉,名稱沿用至今。