清康熙二十二年（1683），清政府在黑龍江左岸，設鎮守黑龍江等處將軍，駐兵建城，稱黑龍江城，又稱舊璦琿。
清康熙二十四年（1685），黑龍江將軍移駐黑龍江右岸，駐兵兼程，稱新璦琿。
清宣統元年（1909年），設置璦暉兵備道和璦琿直隸廳，暖揮城為道暑和廳署駐地。
1912年，璦琿兵備道遷往黑河鎮，改為黑河道。
1913年3月，將璦琿直隸廳改為暖琿縣。
1925年，改為第一區。
1936年，設璦琿保。
1944年1月，改為璦琿村。
1945年，設置璦琿區。
1951年，改為第三區。
1956年4月，撤區劃鄉，設璦琿鄉。
1956年9月，對生僻字地名進行簡化時，經黑龍江省人民政府批準將“璦琿”兩字改為同音“愛輝”。
改設愛輝公社。
1983年7月，成立愛輝鎮。
2015年4月9日，復稱璦琿鎮。
名稱沿用至今。