民國三十七年（1948年），設南開鎮(zhèn)。
1950年7月，撤銷南開鎮(zhèn)建南開鄉(xiāng)。
1953年4月，設南開區(qū)。
1958年8月，南開區(qū)改為南開公社（區(qū)級），南開鄉(xiāng)改為南開管理區(qū)。
1961年7月，南開公社改為南開區(qū)，南開管理區(qū)改為南開公社（鄉(xiāng)級）。
1983年4月，南開公社改為南開鄉(xiāng)。
1992年5月3日，土角鄉(xiāng)、塢鉛鄉(xiāng)、南開鄉(xiāng)合并為南開苗族彝族鄉(xiāng)。
2020年7月，國務院正式批復同意該省調(diào)整六盤水市部分行政區(qū)劃，決定將水城縣的南開苗族彝族鄉(xiāng)，劃歸六盤水市鐘山區(qū)管轄。