清雍正八年（1730年），置古州廳后劃為南路苗寨。
民國六年（1917年），屬南區。
民國二十年（1931年），轄地分屬八蒙、高排2鄉，東三區。
民國二十六年（1937年），屬興華聯保辦公處領地，隸五區。
民國二十九年（1940年），屬興華聯保隸三區。
民國三十二年（1943年），屬興華鄉，直屬縣。
1950年11月，沿屬興華鄉，隸五區。
1953年，置水尾鄉。
1954年，定威鄉的水盆村、計劃鄉的高望村劃歸水尾鄉，隸八開區。
1957年1月2日，劃歸三都水族自治縣九阡區。
1958年9月，撤區鄉建公社，置英雄公社（水尾公社），隸九阡公社（大公社）。
1963年7月，回榕江縣，置水尾水族民族鄉管理委員會，隸八開區。
1964年，改置水尾公社管理委員會，隸八開區。
1984年，復置水尾水族民族鄉。
1992年，撤區并鄉建鎮，置水尾水族鄉。