清光緒三年(1877年),設蒲津鄉,屬南寧府宣化縣。
民國二十一年(1932年),改稱邕寧縣蒲津區。
民國二十二年(1933年),蒲津鄉改為蒲津,屬八尺區。
1950年6月,蒲津鎮改蒲津鄉,屬邕寧縣第三區。
同年8月,邕寧縣遷治蒲廟,屬南寧專區。
1951年3月,蒲津鄉改屬邕寧縣第三區屬第一區。
同年8月,邕寧縣遷治今南寧市興寧區五塘鎮。
1952年8月11日,邕寧縣改屬桂西僮族自治區賓陽專區。
1953年1月,邕寧縣又復遷治蒲廟。
1955年8月,設蒲廟區。
1956年3月2日,邕寧縣改隸桂西僮族自治州;次年12月20日,邕寧縣改屬邕寧專區。
1958年2月,蒲廟區改為蒲廟鄉。
同年8月,蒲廟鄉與新江、那秀鄉合并設星火公社。
11月14日,邕寧縣改屬南寧專區。
1959年4月,星火公社改為蒲廟公社。
1961年5月,蒲廟公社改為蒲廟區。
1968年12月,蒲廟區撤改為蒲廟公社。
1971年,邕寧縣改屬南寧地區。
1980年1月,蒲廟公社析置蒲廟鎮。
1983年10月8日,邕寧縣改隸南寧市。
1984年9月,蒲廟公社改為蒲廟鄉。
1987年10月,蒲廟鄉撤銷并入蒲廟鎮。
2004年9月,蒲廟鎮改隸南寧市邕寧區。