1940年為上大、興義2村，屬矮山鄉(xiāng)。
1949年屬會仙區(qū)。
1952年設睦洞鄉(xiāng)，屬臨桂縣第八區(qū)。
1954年屬臨桂縣第五區(qū)。
1958年改睦洞大隊，屬會仙公社。
1959年分為興義、上樂2大隊。
1961年改為睦洞、上樂2大隊。
1962年與五福大隊合設睦洞公社，屬會仙區(qū)。
1966年改睦洞大隊，并析五福大隊歸山尾大隊，屬紅旗公社。
1973年屬會仙公社。
1984年改睦洞村，設立睦洞村民委員會，屬會仙鄉(xiāng)。
1987年改設睦洞村公所。
1995年復設睦洞村民委員會。
1997年屬會仙鎮(zhèn)。
此地名一直沿用至今。