建制始于明洪武二年（1369）。
清康熙四十四年（1705）設立英德縣浛屬清二都美村圖、石灰鋪圖。
清道光十六年（1836），設立美村鄉、石灰鄉。
1936年設立石美鄉。
新中國成立后，設立美村鄉、竹田鄉、惟山鄉，隸屬于英德縣第二區。
1952年3月設立英德縣第五區。
1955年8月設立美村區。
1957年11月設立美村鄉。
1958年9月屬紅旗人民公社，1959年4月從紅旗人民公社析出設立石灰鋪人民公社。
1983年7月撤社設立石灰鋪區公所，1986年11月撤區設立石灰鋪鎮，沿用至今。