相傳北宋靖康元年（1126），此處已成村落，隨后陸地擴展，居民增多，南宋德祐元年（1275）始成睦洲。
清康熙縣志地圖可見睦洲，屬潮居都十九圖。
民國時期屬第八區睦洲鄉。
1951年屬第九區睦洲鄉。
1958年稱睦洲管理區。
1959年分稱沖尾大隊、占源里大隊、江安里大隊、承恩里大隊、上凌大隊。
1961年分為上寧大隊、承恩大隊、占元大隊、江安大隊、充美大隊。
1965年合稱睦洲大隊。
1984年稱睦洲鄉。
1986年稱睦洲村委會。
1988年改稱睦洲管理區。
1999年改稱睦洲村委會，沿用至今。