該村在清代時屬于香山縣，民國時期屬香山縣，1925年香山縣改為中山縣，南沙灣村屬中山縣第五區(qū)。
1949年中華人民共和國成立后，屬中山縣第五區(qū)。
1953年珠海縣成立，屬珠海縣。
1957年1月執(zhí)行珠海縣“撤區(qū)并鄉(xiāng)，成立鎮(zhèn)、鄉(xiāng)、場”建制，屬于前山鄉(xiāng)管轄。
1984年6月15日珠海市設立香洲區(qū)，南沙灣村屬香洲區(qū)，1987-2000年屬香洲區(qū)前山鎮(zhèn)，2001年撤鎮(zhèn)改街道，進行“村轉(zhuǎn)居”改革，設立南沙灣居委會，并沿用至今。