明清時期，西樵境域屬南海縣江浦司鼎安都。
下轄簡村、云津、百滘、先登、海舟、金甌等堡。
民國二十五年（1936年），區鄉縮編后，民樂、百滘、上金甌鄉和簡官、先登、崇德、海舟、下金甌鄉、官山鎮分屬第七、八區。
民國三十五年（1946年），統歸第一區。
1949年后，從第一區分出，為第七區。
1955年后，分為民樂區、官山區。
1958年9月，成立西樵人民公社。
1983年底，撤銷公社恢復區建制。
1987年，撤區建鎮。
1994年3月，改名為西樵山旅游度假區。
1994年，九江鎮的大同、朝山、七星、顯崗，西岸（1997年，西岸劃出設鎮，2001年重新并入西樵）和沙頭鎮的山根共6個管理區劃入西樵。
2002年12月18日，經廣東省人民政府同意將南海區的西樵山旅游度假區更名為西樵鎮。