明萬歷三年（1575年）設協守漳、潮等處專駐南澳副總兵。
翌年在隆澳筑城，與深澳、云澳互為犄角。
鎮境東部古稱隆澳，名源于前江灣畔隆眼砂澳。
清《南澳志》載：“隆澳南北皆面海，南為大海，北為內海，南稱前江，北稱后汐，澳人讀汐若宅，故亦作后宅。”民國三年（1914年），南澳分設三區，隆澳為第二區。
民國二十二年（1933年），由廣東民政廳訓令，準南澳縣設隆澳第二行署。
從此，南澳縣城從深澳遷移到隆澳（隆澳即今后宅鎮）。
1954年5月，南澳劃歸粵東行政公署管轄，設置后宅鎮。
1961年3月，改設為后宅公社。
1984年2月，經廣東省政府批準，后宅公社改設為后宅鎮。