坑梓建制較晚，行政區劃與坪山幾經并析。
明清時期，坑梓屬歸善縣。
民國元年（1912年），歸善縣更名惠陽縣，坑梓屬惠陽縣。
民國二十年（1931年）9月，惠陽縣開始劃分區、鄉、鎮，坑梓第一次成為鄉級建制。
新中國建立后，坑梓鄉隸屬惠陽縣第四區。
1957年12月，撤區并鄉，坑梓鄉并入坪山鄉。
1958年10月，成立公社，坑梓隸屬惠陽縣坪山公社。
同年11月，坪山公社劃歸寶安縣，坑梓隸屬關系隨之變更。
1961年7月，從坪山公社分出，成立國營坑梓農場，直屬廣州市農墾局。
1963年1月，國營坑梓農場改為坑梓大隊，復歸坪山公社管轄。
1983年7月，改公社為區，隸屬坪山區。
1986年10月，從坪山鎮析出，成立坑梓鎮。
1993年1月，寶安撤縣分設寶安、龍崗二區，坑梓鎮隸屬龍崗區。
2004年，龍崗區全部撤鎮設街，坑梓街道仍屬龍崗區管轄。
2016年10月20日，原坪山、坑梓兩個街道劃分為坪山、馬巒、碧嶺、石井、坑梓、龍田6個街道。
2017年1月7日，坪山區成立，坑梓街道隸屬坪山區。