在明末時曹步仍為一片荒涼之地，位處于珠江三角洲，西江口上游由泥沙所沖積而成之一片平原，在明崇禎八年曹，李，鄭三兄弟到達于今稱曹步時稱茶步之地，當時此地有種茶樹而得名，由于曹世賢習得祖傳醫術，專為人治病，醫術極為精湛加上口才亦佳，前來求醫者甚眾三人所選之址乃茶步溪邊，由于四鄉求醫者眾，又不熟悉路途，常問路于人，每皆簡單于上曹醫生居溪邊，漸演變成曹溪，曹溪因此得名，后來在岸邊建碼頭，遂稱曹埠，后寫成曹步。
1958年分設曹一至曹六共6個大隊，此屬曹步第三，四大隊。
1965年2大隊合并，稱曹三。
1965年析設立曹三大隊。
1983年稱曹三鄉。
1986年改稱曹三村委會。
1990年稱曹三管理區。
2001年撤區復稱曹三村委會至今。