原為百家鎮隸屬于地，1949年初隸屬于白沙區秦亭鄉；1958年隸屬于山門公社柳林大隊；1965年為柳林公社秦子鋪大隊；轄秦子鋪、胡窯、喬窯、張灣、溫家、魯堡、時家那面、深溝8個小隊；1984年為秦亭鄉秦亭村后，8個小隊又為秦亭村后小組；2004年秦亭建鎮，秦亭村轄秦子鋪、胡窯、喬窯、張灣、溫家、魯堡、時家那面、深溝八個自然村。
民國時期為保甲制，1949年初為秦亭村人民代表大會，1955年至1958年為秦亭農業合作社，1958年至1980年為秦亭生產大隊，1983年至今為秦亭村村民委員會。