1934年保甲制時，李店為上邽鎮43保中的第33保(糜李村）；1950年至1955年李店村為紅土鄉；1956年至1957年李店村為紅富鄉；1958年為城關鎮躍進人民公社；1961年12月，從城關鎮人民公社劃出紅堡人民公社后，為李店大隊。
1983年為紅堡鄉李店村民委員會；2004年1月為紅堡鎮李店村民委員會。
2004年12月，北坡村撤銷，并入李店村。
2007年李店從山上易地搬遷在山下居住。
民國時期為保甲制，1949年初為李店村人民代表大會，1955年至1958年為李店農業合作社，1958年至1980年為李店生產大隊，1983年至今為李店村村民委員會。