成立于1953年，行政區劃調整后，稱張掖縣梁家墩鄉清涼寺大隊，1958年撤縣建市，稱張掖市梁家墩鄉清涼寺大隊，1961年恢復張掖縣，稱張掖縣梁家墩鄉清涼寺大隊。
1962年改為梁家墩公社清涼寺大隊，1967年文革期間更名為先鋒公社清涼寺大隊，1970年6月恢復為梁家墩公社清涼寺大隊。
1983年11月更名為梁家墩鄉清涼寺村民委員會，1997年10月撤鄉建鎮，稱張掖市梁家墩鎮清涼寺村民委員會，2002年7月張掖市撤市成立甘州區，更名為甘州區梁家墩鎮清涼寺村民委員會至今。