自“三國(guó)”東吳永安三年260年至北宋熙寧三年（1070年），屬劍浦縣（今南平）的交溪鄉(xiāng)，長(zhǎng)興四年至明、清屬順昌縣交溪鄉(xiāng)。
民國(guó)屬順昌縣地域的第一區(qū)。
1951—1955年元坑為順昌四區(qū)，1956年改名福秀區(qū)，1958年撤區(qū)改為元坑鄉(xiāng)。
1958年10月成立順昌人民公社，元坑為福秀分社，1959年撤銷順昌人民公社，元坑為紅旗人民公社，轄3個(gè)管理區(qū)（即：元坑、鄭坊、謨武）。
1961年7月鄭坊和謨武另設(shè)公社。
1966年5月撤銷謨武公社，劃歸元坑公社管轄。
1973年5月武坊大隊(duì)劃歸大干公社管轄。
1984年10月元坑公社管理委員會(huì)改為元坑鄉(xiāng)人民政府。
1992年8月撤鄉(xiāng)建鎮(zhèn)。